野生鸟类在禽变肺病毒流行病学中的作用更好表征病毒宿主的广度

2024-05-01 20:48:58 产品资讯

  鉴于全球家禽中存在的禽源性中性粒细胞减少症病毒疾病负担,以及有可能由野生鸟类在该病毒流行病学中发挥作用的证据,本研究通过进行系统综述和荟萃分析。

  总结了有关自由放养的鸟类中aMPV血清学和分子数据的文献资料。在PubMed、Scopus、CABDirect和WebofScience上进行了计算机化文献检索。

  以识别在1990年至2021年期间的相关出版物,并筛选了参考文献目录。采用随机效应模型计算了带有95%置信区间的汇总患病率估计。

  应用不一致性指数统计来评估研究间的异质性。仅对分子研究进行了亚组分析,根据采样地区、分类学目、属和受调查鸟类的迁徙模式。

  共有11篇分子调查的出版物和6篇血清学调查的出版物被保留用于分析。分子患病率汇总为6%,检测到高的研究间异质性。

  鼓励进一步对野生鸟类做出详细的调查,以更好地理解aMPV流行病学中的家禽/野生鸟类界面,并更好地表征病毒的宿主广度。

  aMPV通过直接传播,在火鸡、鸡、家鸭和珍珠鸡中引发上呼吸道疾病和生殖系统障碍,进而对全球家禽业产生经济和福祉问题。

  迄今为止,根据遗传或抗原特性,已经确认了四种aMPV亚型。最近在北美发现的不同系统发育的aMPV菌株表明存在额外的病毒亚型。

  特别是在大黑背鸥中检测到了一种不同的aMPV菌株,另一种在一只修道士鹦鹉雏鸟中检测到。

  就病毒传播而言,aMPV-A和B几乎遍布全球,尤其在亚洲、非洲、欧洲和南美洲广泛分布。aMPV-C,已在北美和欧亚两个遗传谱系中进一步确认,出现在美国及在法国和中国。

  从宿主范围的角度看,aMPV亚型也不一样。aMPV-A、B和C主要感染火鸡或鸡,而欧亚亚型C谱系则感染鸭子,亚型D感染火鸡。

  然而,实验性证据说明,亚型的宿主范围可能更复杂,自20世纪70年代末首次在南非出现以来,aMPV的起源和全球传播一直被归因于多种因素。

  其中包括野生鸟类及其沿着自然飞行路径的迁徙活动。特别是,aMPV在美国明尼苏达州忽然出现,该州拥有大量的候鸟种群,这强烈支持了这一假设。

  在北美的火鸡aMPV爆发期间观察到的季节性模式以及在疫区之外野生鸟类中检测到的aMPV,都暗示了野生物种可能充当了病毒的携带者或储存宿主。

  在过去二十年内,美洲和欧洲报道的有关aMPV在自由生活鸟类中的病毒或血清学证据进一步证明了非家养物种中的实际病毒循环。

  考虑到提供家禽/野生鸟类界面疾病广泛概述的研究已经为引导未来研究提供了宝贵信息,本研究旨在评估关于野生鸟类中aMPV发生的当前知识。

  考虑到全球家禽中aMPV疾病的负担以及野生鸟类在aMPV流行病学中可能发挥的作用的证据。

  本研究通过进行系统综述和荟萃分析,总结了有关自由放养的鸟类中aMPV血清学和分子数据的文献资料。

  尽管aMPV感染已经被广泛回顾,但据我们所知,这是首次关注野生鸟类中aMPV发生的系统综述和荟萃分析。

  关于野生鸟类在aMPV流行病学中作为储存宿主或附带现象的潜在作用尚未完全揭示。

  野生鸟类中aMPV的分子患病率汇总为6%。根据采样鸟类的地理区域、分类目和属以及迁徙模式进行了亚组分析。

  结果表明,在每个地理子组的汇总效应估计之间有显著差异,南美洲的患病率最高,其次是北美洲和欧洲。分类目和属似乎都会影响效应估计。

  就分类目而言,雀形目的病毒流行率最高,其次是鸽形目和隼形目。根据属来看,Passer的患病率最高,其次是Columba和Falco。最后,受调查物种的迁徙模式似乎并不显著。

  关于野生鸟类中aMPV的总体血清患病率,估计为14%。鉴于缺乏可用的数据,对于血清学研究,未进行地理区域、被调查鸟类的分类目、属和迁徙模式的亚组分析。

  尽管数据有限,但我们的研究首次应用了系统文献综述和荟萃分析,以总结野生鸟类中aMPV的血清学和分子学流行病学数据,是识别研究空白并鼓励未来研究方向的必要步骤。

  所采用的文献检索策略检索到的分子研究比血清学研究更多,这可能是因为基于PCR的技术在检测传染性因子方面的应用增加了,相对于血清学。

  荟萃分析的总体结果显示,野生鸟类对aMPV存在中度曝露。鉴于荟萃分析所显示的高研究间异质性,需要将汇总估计与95%置信区间一起考虑。

  可能存在的异质性来源可能与所使用的检测方法的不同敏感性和特异性、研究区域、分析的不同样本类型以及受采样野生鸟类的生态习性有关。

  在分子研究中,针对不同基因片段的靶向很可能影响了在测试野生鸟类时获得的结果,这是因为所使用的RT-PCR检测方法具有不同的亚型特异性。

  关于血清学调查,使用具有不同敏感性和特异性水平的检测方法可能进一步影响了获得的结果的准确性。

  根据亚组分析,我们的结果显示了aMPV分子学检测结果与采样地点之间存在统计学显著关联。

  然而,考虑到我们的数据集中只提取了三个分类变量,涉及到研究地理分布,我们认为这对于全球趋势的代表性较差。

  北美地区,最初的aMPV检测与家禽向自由生活的野生物种的溢出事件有关。检测到aMPV-C分子,并成功分离出健康的加拿大雁后,作者们认为野生鸟类是自然的病毒储存库。

  Turpin等报告了aMPV-C在美国家禽非疫区之外的发生情况,他们在佐治亚州、南卡罗来纳州、阿肯色州和俄亥俄州的美洲秧鸡和加拿大雁中检测到了aMPV-C的抗体和病毒RNA。

  Jardine等在加拿大的水鸟中也发现了野生物种中的aMPV-C直接证据,而家禽中从未报告过aMPV感染。

  至于南美洲,aMPV亚型A和B被检测到在许多自由生活的野生物种中,以及在康复中心寄养的个体中,这可能意味着在圈养鸟类中采样的鸟类之间传播aMPV。

  至于欧洲,荷兰采样的野生绿头鸭、大雁和普通海鸥中分子检测到aMPV亚型C,而在意大利采样的野生水禽中也检测到了aMPV。

  在德国还通过RT-PCR检测到了自由生活的雉鸡,但没有进一步进行病毒亚型分型。

  对分子检测的野生鸟类的订单和属之间的统计比较揭示了这些调节因素与aMPV分子患病率之间存在非常明显关联。

  然而,并不是所有在亚组分析中包括的分类单元都在超过一个研究中有所代表。雀形目、鸽形目和隼形目显示了最高的分子/病毒患病率结果。

  尽管由于抽样不足可能会影响了结果而存在抽样偏差。事实上,雀形目仅由家麻雀代表,而隼形目则由美国红隼代表,这两者都仅进行了一次采样。

  至于鸽形目,这个分类单元也包括了一个被采样的物种,即鸽子,它被调查了两次。家麻雀、美国红隼和鸽子是常见的栖息在农田生态系统中的物种。

  因此可能会通过经常出没在家禽养殖场周围而接触到aMPV。关于家麻雀和/或鸽子,关于aMPV的实验感染结果存在争议。

  当前的证据不允许为这些物种分配明确的流行病学作用,尽管它们似乎更可能是附带现象。分子和血清学证据说明,一些野生鸟类可能在aMPV流行病学中发挥作用。

  特别是根据目前考虑的科学贡献,野生鸭、雁、雉鸡和海鸥都被证明对aMPV感染具有敏感性。

  考虑到aMPV-C的欧亚谱系适应性较强的特点,进一步对野生水禽的调查可能会揭示潜在的aMPV储存宿主物种。

  虽然关于aMPV分子检测与迁徙模式之间的关联的调节分析结果不具有统计学意义,但物种的迁徙或非迁徙态度仍然值得进一步考虑。

  可以合理假设,迁徙鸟类可能会影响aMPV沿着迁徙飞行路径的传播,特别是对于aMPV亚型C,正如对禽流感已经证明的那样。

  特别是,在从未报告过该亚型感染家禽的领土上采样的野生迁徙物种中检测到aMPV-C支持了这一假设。

  欧亚和美洲野生鸟类的单独迁徙习性也可能在塑造aMPV-C的遗传多样性方面具有相关性,这已经识别出两个不同的谱系。

  另一方面,就驻留的野生鸟类物种而言,它们可能在家禽养殖场与潜在的自然储存宿主物种之间,或者在不同家禽场之间发挥桥梁作用。

  考虑到aMPV-A、B或C更适应鸡形鸟类,因此,野生鸡形目,如雉鸡,可能参与病毒流行病学。

  有关aMPV-A或B亚型在自由生活或养殖雉鸡中的感染证据,以及在韩国一个活禽市场采样的雉鸡中检测到aMPV-C的分子证据。

  阐明了这个领土物种在与自由放养雉鸡在农村地区或家禽养殖场周围经常观察到的家禽/野生动物界面的局部aMPV循环方面的潜在影响。

  最后,关于海鸥,它们的食性可塑性以及它们对aMPV的感受性的证据说明它们可能参与了病毒流行病学。

  事实上,鸥类被认为是杂食性肉食动物,它们使用不相同的栖息地作为筑巢地点,并消耗海洋和陆地食物资源。

  鼓励进一步在野生鸟类中进行aMPV调查,以更好地理解aMPV流行病学并更好地描述病毒的宿主范围。

  考虑到aMPV通过非间接接触传播,野生物种的合群性可能是在选择要测试的物种时需要仔细考虑的重要特征。

  此外,准确记录已测试个体的分类和人口信息,特别是性别和年龄类别,对于注意特定aMPV感染模式至关重要。

  采样位置数据将有利于理解野生自由放养的鸟类与家禽养殖场上aMPV发生之间的流行病学联系。

  每当讨论阳性结果时,对宿主生态的彻底研究可能会有助于进一步的流行病学考虑。

  就所应用的诊断方法而言,为了尽最大可能避免低估新鸟类中aMPV的循环并揭示病毒在野生宿主中分布的不明显方面。

  模oderator分析显示,根据研究地区、分类学目和属的不同,存在统计学上显著的差异。关于血清学患病率,获得了一个汇总估计为14%,并伴随着高的研究间异质性。

  由于合格的血清学研究数量有限,未进行主持分析,分子和血清学证据说明,一些野生鸟类可能在aMPV的流行病学中发挥作用。

  特别是根据所考虑的科学贡献,野生鸭、雁、鸥和雉鸡被证明对aMPV具有敏感性,并由于宿主生态学的原因,可能充当病毒的携带者或储存库。

  强烈建议选择不特异亚型的分子协议,并进一步通过测序对阳性结果进行进一步的表征。